ИНФОРМАЦИОННОЕ ПИСЬМО
Центра экологии и эпидемиологии гриппа,
Национального центра по гриппу ВОЗ
на базе Института вирусологии им. Д.И.
Ивановского
ФГБУ «НИЦЭМ им. Н.Ф. Гамалеи» Минздрава
России
«О заболеваемости гриппом и ОРВИ в России
и мире в эпидемическом сезоне
2020-2021 гг. (с 40 недели 2020г. по 26
неделю 2021г.)»
В рамках осуществления эпидемиологического надзора за циркуляцией возбудителей ОРВИ, в том числе, вирусов гриппа и SARS-CoV-2 в РФ, Центр экологии и эпидемиологии гриппа (ЦЭЭГ), Национальный центр по гриппу, сотрудничающий с ВОЗ (НЦГ) на базе Института вирусологии им. Д.И. Ивановского ФГБУ «НИЦЭМ им. Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России в сотрудничестве с 10 опорными базами, представленными Территориальными управлениями и ФБУЗ «Центрами гигиены и эпидемиологии» Роспотребнадзора в Европейской части (гг. Новгород Великий, Липецк, Владимир, Ярославль, Пенза и Чебоксары), на Урале (г. Оренбург), в Сибири (г. Томск) и на Дальнем Востоке (гг. Владивосток и Биробиджан), провели оценку особенностей циркуляции возбудителей ОРВИ, в том числе гриппа и SARS-CoV-2, в сезоне 2020-2021 гг. на отдельных территориях РФ, регионах ВОЗ и некоторых странах мира, а также ситуации по случаям инфицирования людей вирусами гриппа птиц и свиней.
1. Активность возбудителей ОРВИ на территориях, сотрудничающих с ЦЭЭГ.
Заболеваемость гриппом и ОРВИ. На сотрудничающих с ЦЭЭГ территориях превышения эпидемического порога заболеваемости ОРВИ по отношению к среднему показателю по РФ (72,6 на 10 000 населения) регистрировали в период 40-51 недель 2020г. включительно. В последующий период наблюдения показатели не превышали пороговое значение (Рисунок 1).
Рисунок 1. Динамика средних показателей заболеваемости гриппом и ОРВИ по совокупному населению на 10 опорных базах ЦЭЭГ в сезонах 2020-2021гг. и 2019-2020гг.
Превышения показателей заболеваемости ОРВИ по совокупному населению в городах регистрировали в период следующих недель: в Великом Новгороде (45-48, 50), Липецке (42-44, 50, 51), Владимире (46-52, 1, 4, 25, 26), Ярославле (47-49, 26), Пензе (42 - 3, 24-26), Чебоксарах (44-50, 26), Оренбурге (40-48, 51, 52, 2, 20-26), Томске (40-51, 24-26), Владивостоке (43-52, 2, 3, 24-26) и Биробиджан (40-43, 2, 5); у детей от 0 до 2 лет – Липецке (22) и Владивостоке (19); у детей от 3 до 6 лет – Владимире (25), Чебоксарах (45), Оренбурге (20-23), Владивостоке (16, 19, 21, 22, 23, 25); в группе 7-14 лет – Великом Новгороде (43, 24, 26), Липецке (42, 24), Владимире (47, 49, 50), Ярославле (26), Оренбурге (42, 2, 24), Томске (40-43), Владивостоке (40) и Биробиджане (40, 48, 2,5); 15 лет и старше - Великом Новгороде (42, 45-48, 2,3,20, 22-26), Липецке (41-47, 51, 9, 25, 26), Владимире (41 – 7,16, 19, 23-26), Ярославле (42-45, 47-49, 25,26), Пензе (42-3, 24-26), Чебоксарах (40, 42-53, 2-4, 11, 19-26), Оренбурге (40-11, 13-16, 19-26), Томске (40-52, 1,2,10, 19-26), Владивостоке (40-17, 19-26) и Биробиджане (40-48, 1,2,4,5,16,19, 24-26).
Максимальные превышения показателей эпидпорогов зарегистрированы: по совокупному населению в период 25 недели во Владивостоке (+247,2%); у детей от 0 до 2 лет – в период 19 недели во Владивостоке (+7,0%), у детей от 3 до 6 лет - в период 45 недели в Чебоксарах (+24,5%), в возрастной группе 15 лет и старше - в Липецке в период 26 недели 2021г. (+1308,7%), во Владивостоке - 2 и 24 недель 2021г. (+856,4% и +1169,2% соответственно), Биробиджане – 43 недели 2020г. (+447,2%) и 26 недели 2021г. (+228,6%), Томске - 45 недели 2020г. (+378,4%), Чебоксарах 46 недели 2020г. (+252,7%), Оренбурге – 44 недели 2020г. (+350,7%).
Как и в предыдущие сезоны, наиболее высокие показатели заболеваемости ОРВИ регистрировали у детей 0-2 лет (214,1) и 3-6 лет (213,5), при этом они были значительно ниже по сравнению с предыдущим сезоном 2019-2020гг. (321,7 и 300,3 соответственно) (Таблица 1). Заболеваемость ОРВИ у школьников была также ниже по сравнению с предыдущим годом, в тоже время, показатели взрослого населения практически во всех городах (за исключением г. Ярославля) были значительно выше; разброс значений составил 29,1-53,7 (11,3-42,8 / 10,2-42,8 соответственно). Среди городов с наиболее высоким приростом показателей заболеваемости ОРВИ у взрослых необходимо отметить гг. Владивосток (в 3,4 раза), Биробиджан (2,0), Томск (1,9), Липецк и Оренбург (1,7), Вел. Новгород (1,5).
Госпитализация пациентов с диагнозом «грипп» на сотрудничающих с ЦЭЭГ территориях. Оценить показатели не представляется возможным по причине крайне низкой активности вирусов гриппа в указанный период.
Таблица 1.
Средняя заболеваемость ОРВИ по 10 городам РФ, опорным базам ЦЭЭГ, в период с 40 недели 2020г. по 26 неделю 2021г. Сравнение с этим же периодом сезона 2019-2020гг.
|
Города |
Заболеваемость ОРВИ (на 10 000) в разных возрастных группах в сезонах 2020-2021 / 2019-2020гг. |
||||
|
Всё население |
0-2 года |
3-6 лет |
7-14 лет |
15 лет и старше |
|
|
Вел. Новгород |
64,9 / 61,4* |
281,8 / 313,2 |
295,5 / 261,5 |
170,0 / 67,8 |
40,4 / 27,6 |
|
Липецк |
56,7 / 52,1 |
355,0 / 323,1 |
316,0 / 318,2 |
156,0 / 132,9 |
30,1 /18,2 |
|
Владимир |
72,6 / 75,3 |
297,2 / 389,9 |
286,1 / 342,4 |
123,1 / 137,2 |
48,0 / 42,8 |
|
Ярославль |
40,8 / 36,9 |
114,8 / 118,8 |
124,3 / 164,4 |
67,2 / 69,4 |
22,4 / 21,3 |
|
Пенза |
25,1 / 16,8 |
1,8 / 4,0 |
1,5 / 7,8 |
1,45 / 6,8 |
29,1 / 18,8 |
|
Чебоксары |
67,2 / 60,7 |
141,8 / 147,9 |
138,6 / 153,9 |
79,3 / 91,5 |
53,7 / 45,8 |
|
Оренбург |
71,9 / 59,9 |
249,1 / 285,5 |
267,5 / 288,3 |
109,2 / 120,8 |
47,0 / 28,1 |
|
Томск |
62,0 / 47,3 |
167,8 / 231,5 |
234,4 / 237,2 |
86,4 / 91,0 |
44,5 / 23,8 |
|
Владивосток |
60,5 / 34,7 |
187,8 / 201,1 |
238,0 / 220,7 |
83,3 / 89,2 |
43,7 / 12,8 |
|
Биробиджан |
54,5 / 50,0 |
343,9 / 379,9 |
233,2 / 244,2 |
104,0 / 133,4 |
22,9 / 11,3 |
|
Средняя |
57,9 / 49,5 |
214,1 / 239,5 |
213,5 / 223,9 |
98,0 / 104,0 |
38,2 / 25,1 |
|
Разброс значения |
25,1 - 72,6 / 16,8 - 75,3 |
1,8 - 355,0 / 4,0 - 389,9 |
1,5 - 316,0 / 7,8 - 342,4 |
1,5 – 170,0 / 6,8 – 167,8 |
29,1 – 53,7 / 11,3 – 42,8 |
*- заболеваемость ОРВИ (на 10 000) в сезонах 2020-2021 / 2019-2020гг.
Данные госпитального надзора (по данным ЦЭЭГ, г. Москва). Обследовано 1072 пациента, госпитализированного в инфекционный стационар г.Москвы с гриппоподобными симптомами с декабря 2020г. по март 2021г. Пациенты поступали в разные сроки болезни (с 1 по 14 день). Госпитализированные пациенты были в возрасте от 18 до 97 лет; мужчин – 446 (41,6%), женщин – 626 (58,4%).
В возрастной структуре преобладали лица старше 50 лет – 83,5% (895 пациентов), лица до 30 лет составили 1,5% (16), от 31 до 50 лет – 15,0% (161).
У лиц в возрасте от 61 до 70 лет частота тяжелого течения болезни составила 26,4%, что было выше, чем в других возрастных когортах. Например, у лиц до 40 лет частота тяжелого течения составила 7,6%. Из 1072 пациентов с COVID-19 72 были переведены в ОРИТ, из них женщин – 80,5%, мужчин – 19,5%. Все пациенты нуждались в респираторной поддержке и соответствовали 7 и более категории шкалы NEWS: высокопоточную оксигенацию получили 40,3% пациентов, ИВЛ – 59,2%. Умер 51 пациент, что составило 70,8% от лиц, находившихся в ОРИТ, и 4,8% от общего числа наблюдаемых пациентов.
Диагностический алгоритм включал анализ эпидемиологических, клинических и лабораторных методов, в том числе, вирусологические исследования (определение РНК вируса SARS-CoV-2 и РНК вирусов гриппа А и В с помощью ПЦР в назальных смывах). Согласно результатам вирусологических исследований назальных смывов РНК вируса SARS-CoV-2 была обнаружена у 583 (56,0%) пациентов (МКБ 10 – U07.1), в остальных случаях (489 пациента) диагноз COVID-19 был подтвержден на основании типичных клинических, рентгенологических и лабораторных данных (МКБ 10 – U07.2). Весь исследованный биоматериал от пациентов был отрицательным на вирусы гриппа.
Мониторинг случаев ТОРИ (по данным ЦЭЭГ, г. Москва). За отчётный период (45 неделя 2020г. – 25 неделя 2021г.) было включено 587 пациентов с тяжелыми и средне-тяжелыми формами ОРВИ: 337 женщин и 250 мужчин. Возраст пациентов распределился следующим образом: 15-29 лет – 5 (1%) пациентов, 30-64 года – 294 (50%) пациента, 65 лет и старше – 288 (49%) пациентов. У 12 (2,0%) пациентов в анамнезе вакцинация против коронавирусной инфекции. У всех пациентов диагностирована пневмония. Зарегистрировано 7 (1,2%) летальных случаев, этиологически связанных с SARS-CoV-2.
Среди сопутствующих диагнозов: болезни сердца, в том числе, гипертоническая болезнь – 350 (59,6%) случаев, хронические болезни бронхов и лёгких – 58 (9,9%) случаев, ожирение – 148 (25,2%) случаев, болезни пищеварительного тракта – 44 (7,5%) случая, болезни почек – 30 (5,1%) случаев, болезни печени - 21 (3,6%) случай, нарушения мозгового кровообращения - 42 (7,2%) случая, нарушения со стороны нервной системы – 21 (3,6%) случай, болезни щитовидной железы – 55 (9,4%) случаев, подагра – 4 (0,7%) случая, диабет 31 (5,3%) случай, новообразования – 62 (10,6%) случая, ВБВНК – 32 (5,4%) случая, астма – 7 (1,2%) случаев, глаукома и катаракта – 6 (1%) случаев, артроз – 5 (0,8%) случаев, псориаз – 2 случая, склеродермия – 1 случай.
Частота диагностирования возбудителей ОРВИ составила: SARS-CoV-2 – 372 случая (63,4%); парагрипп (PIV) - 1, метапневмовирус (MpV) - 1, сезонный коронавирус (CoV) – 2 случая. Случаев гриппа диагностировано не было.
Диагностика случаев ОРВИ. Частота положительных находок на ОРВИ методом ОТ-ПЦР, в том числе, парагриппа (PIV), аденовирусов (AdV), Рс-вируса (RsV), риновирусов (RV), бокавируса (BoV), метапневмовируса (MPV), α-коронавируов (CoV) и новго коронавируса (SARS-CoV-2) в период октября 2020г. – июня 2021г. представлена на Рисунке 2.
Рисунок 2. Динамика частоты выявления положительных образцов на возбудителей ОРВИ и SARS-CoV-2 (%) в клинических материалах методом ОТ-ПЦР в период 40 недели 2020г. – 26 недели 2021г.
Необходимо обратить внимание на несколько особенностей. На фоне общей тенденции к снижению числа позитивных проб на SARS-CoV-2 в анализируемый период (с 29,0% до 19,8%), показатели частоты выявления SARS-CoV-2 практически на протяжении всего сезона были выше по сравнению с частотой выявления возбудителей других ОРВИ. Исключение составили показатели, выявленные в мае-июне 2021г., когда на фоне наиболее низких показателей в отношении SARS-CoV-2, число позитивных проб на возбудителей других ОРВИ были выше. В июне 2021г. на фоне роста активности SARS-CoV-2, частота выявления возбудителей других ОРВИ стала ниже, что в целом коррелирует с динамикой заболеваемости (см. Рис.1).
Определенный интерес представлял анализ долевого участи возбудителей ОРВИ, в том числе, вирусов парагриппа (PIV), аденовирусов (AdV), Рс-вируса (RsV), риновирусов (RV), α-коронавирусов (CoV), бокавируса (BoV), метапневмовируса (MPV) и гриппа в период октября 2020г. – июня 2021г. Данные представлены на Рисунке 3.
Для сравнения приведены результаты диагностики с применением ОТ-ПЦР в период трех сезонов: 2018-2019гг. – сезона до пандемии SARS-CoV-2, 2019-2020гг. – сезона, в период которого (c марта 2020г.) начали регистрировать случаи SARS-CoV-2 с последующим его широким распространением и 2020-2021г. - сезона «доминирования» SARS-CoV-2.
Вирусы парагриппа, аденовирусы, риновирусы и РС-вирус на фоне циркуляции SARS-CoV-2 снизили свою активность, что четко выявлено в периоды с марта 2020г. и текущий сезон 2020-2021гг. (отмечен некоторый рост активности в мае 2021г. на фоне снижения активности SARS-CoV-2, за исключением риновирусов).
В тоже время, прослеживается рост активности бокавируса, альфа-коронавирусов и метапневмовируса в периоды их «сезонной» активности (февраль-апрель 2021г.) на фоне циркуляции SARS-CoV-2, что свидетельствует об отсутствии «биологической конкуренции» между ними.
В текущем сезоне вирусы гриппа детектировали в единичных случаях (всего 4, в том числе, грипп А - 1 (г. Москва, подтип не установлен) и грипп В – 3 (гг. Оренбург, Томск и Москва); принадлежность к эволюционным линиям определить не удалось, как и выделить из клинических материалов штаммы.
Активность возбудителей ОРВИ, в том числе SARS-CoV-2, различалась по регионам РФ. Объем исследований и результаты диагностики ОРВИ методами ОТ-ПЦР и иммунофлюоресценции ФБУЗ «Центров гигиены и эпидемиологии», сотрудничающих с ЦЭЭГ, Москва территорий представлены в Таблице 2.
Текущий сезон 2020-2021гг. отличался от предыдущего 2019-2020гг. небольшим снижением числа исследованных проб, в частности, методом ПЦР на вирусы гриппа было исследовано 13 987 (ранее 17 522), ОРВИ – 12 536 (ранее - 11 553); методом флюоресцирующих антител – 3089 (ранее – 4539), изоляция – 4 . Это было, прежде всего, связано с крайне высокой активностью нового коронавируса SARS-CoV-2, объем исследований в отношении которого составил 52 930 образцов, а также отсутствием в циркуляции вирусов гриппа не только в России, но и во всех странах мира. Из числа положительных на грипп проб (4) выделить штаммы не представилось возможным.
На Рисунке 4 представлены результаты частоты выявления возбудителей ОРВИ в разных регионах страны – городах Европейской части, Урала и Сибири, Дальнего Востока.
Обращают на себя внимание следующие результаты. В городах Европейского части России с большей частотой выявляли вирусы PIV, AdV; на Урале и в Сибири – RhV, BoV и MPV; на Дальнем Востоке – RsV. В предыдущем эпидемическом сезоне долевое участие было несколько отличным в отношении RsV (более активен в Европейской части), BoV (на Урале), RhV и MPV (на Дальнем Востоке). Возможно, такие различия связаны с особенностью текущей ситуации, доминирования SARS-CoV-2, и приоритета проведения лабораторных исследований в отношении этого вируса.
Таблица 2.
Результаты лабораторной диагностики ОРВИ, в том числе, гриппа и SARS-CoV-2 в период октября 2020г. – июня 2021г.
в ЦЭЭГ, Москва и на сотрудничающих с ним территориях
|
ФБУЗ «Центры гигиены и эпидемиологии» городов, областей, республик |
Число положительных образцов, выявленных ОТ-ПЦР на
|
Число положительных образцов, выявленных МФА на ОРВИ | ||||||||||||||
|
грипп |
ОРВИ, сезонные |
SARS-CoV-2 | ||||||||||||||
|
Объем исслед. |
грипп
|
Объем исслед. |
PIV
|
AdV
|
RsV
|
RV
|
CoV |
BoV |
MPV |
Объем исслед. |
SARS- СoV-2
|
Объем исслед. |
PIV |
AdV |
RsV
| |
|
ЦЭЭГ, Москва |
180 |
2 |
226 |
8 |
5 |
1 |
34 |
3 |
16 |
28 |
3856 |
1395 |
|
|
|
|
|
Вел. Новгород |
816 |
|
508 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
368 |
128 |
33 |
18 |
|
Липецк |
3290 |
|
3290 |
128 |
78 |
29 |
142 |
93 |
19 |
6 |
|
|
107 |
3 |
|
|
|
Владимир |
736 |
|
736 |
7 |
70 |
6 |
77 |
10 |
18 |
16 |
697 |
43 |
|
|
|
|
|
Ярославль |
541 |
|
532 |
21 |
5 |
1 |
42 |
2 |
11 |
35 |
20258 |
5675 |
|
|
|
|
|
Пенза |
1422 |
|
1169 |
9 |
8 |
4 |
18 |
13 |
13 |
12 |
891 |
68 |
1061 |
1 |
1 |
|
|
Чебоксары |
2232 |
|
1258 |
|
|
|
|
|
|
|
23354 |
4768 |
1188 |
270 |
227 |
30 |
|
Оренбург |
555 |
1 |
566 |
23 |
2 |
|
48 |
13 |
19 |
21 |
86 |
2 |
|
|
|
|
|
Томск |
836 |
1 |
837 |
10 |
6 |
6 |
71 |
14 |
47 |
35 |
794 |
69 |
341 |
11 |
12 |
|
|
Владивосток |
2773 |
|
2773 |
16 |
14 |
31 |
71 |
13 |
14 |
42 |
1803 |
245 |
|
|
|
|
|
Биробиджан |
606 |
|
641 |
45 |
20 |
57 |
128 |
31 |
5 |
15 |
1191 |
321 |
24 |
|
1 |
|
|
Всего |
13 987 |
4 |
12 536 |
267 |
208 |
135 |
631 |
192 |
162 |
210 |
52 930 |
12 586 |
3089 |
413 |
274 |
48 |
|
% выявления |
100 |
0,01 |
100 |
2,1 |
1,6 |
1,1 |
5,0 |
1,5 |
1,3 |
1,7 |
100 |
23,8 |
100 |
13,4 |
8,9 |
1,6 |
|
% в структуре ОРВИ |
1808 |
0,2 |
|
14,8 |
11,5 |
7,5 |
34,9 |
10,6 |
8,9 |
11,6 |
|
23,8 |
735 |
56,2 |
37,3 |
6,5 |
Рисунок 4. Частота детектирования возбудителей ОРВИ методом ОТ-ПЦР в период октября 2020г. - июня 2021г. на Европейской части РФ, Урале и Сибири, Дальнем Востоке
Молекулярно-генетические исследования. Молекулярно-генетические исследования были проведены совместно с сотрудниками лаборатории ФГБУ «НИЦЭМ им. Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России (Воронина О.Л.), ФГБУ «НИИ гриппа им. А.А. Смородинцева» Минздрава России (Комиссаров А.Б.) и Центра высокоточного редактирования и генетических технологий для биомедицины НИИ трансляционной медицины РНИМУ НПО (Коростин Д.О., Боцманов Е.И.).
Протестировано 45 образцов (носоглоточных смывов), полученных от пациентов, госпитализированных в стационары г.Москвы в текущем сезоне. Большинство из них (39) были отнесены к генетической группе GR (линия В.1.1), включая один образец, который был отнесен к варианту Alpha - 20I/501Y.V1 (линия В.1.1.7, Великобритания): материал от пациента (мужчина 68 лет, с тяжелой острой респираторной инфекцией) был взят в конце апреля 2021г. В этой генетической группе выявлены штаммы с мутациями, характерными для РФ, в частности, городов на северо-западе (В.1.1.317, 5 образцов); а также представители с характерными мутациями для РФ, «московская линия» (В.1.1.523, 5 образцов; В.1.1.397, 1 образец), которые утрачивают в последнее время свою эпидемическую значимость. Кроме того, выявлено 7 образцов, которые были отнесены к генетической группе G, варианту Delta (линия В.1.617, Индия); материалы от госпитализированных пациентов были взяты в марте-июне 2021г.
Полученные результаты указывают на гетерогенность популяции SARS-CoV-2 в г. Москве с представительством новых вариантов (Alpha и Delta), а также эндемичных только для РФ.
2. Ситуация в зарубежных странах.
Активность вирусов гриппа и их распространение. Как в странах Северного, так и Южного полушарий (не зависимо от сезонной активности) вирусы гриппа детектировали только в спорадических случаях, что определило крайне низкие показатели заболеваемости, госпитализации и летальности. Несколько большую активность вирусов гриппа (описаны отдельные вспышки) регистрировали в странах с тропическим, субтропическим и экваториальным климатом на протяжении всего периода. Глобально низкая активность вирусов гриппа была связана с продолжающейся циркуляцией нового коронавируса SARS-CoV-2, его изменчивостью и введением карантинно-ограничительных мероприятий, в том числе, ограничений по передвижению людей как внутри страны, так и между странами; а также, по-видимому, «биологической конкуренции» вирусов.
По данным ВОЗ, к 6 июля 2021г. во всех странах мира проведено исследование более 4,5 миллионов проб клинических материалов, из которых 10 147 (0,2%) оказались положительными на вирусы гриппа. Долевое участие распределилось следующим образом: грипп типа А – 2539 (25,0%) и грипп типа В – 7608 (75,0%); среди субтипированных вирусов гриппа А – 14,0% пришлось на A(H1N1)pdm09 и 34,0% - A(H3N2); среди субтипированных вирусов гриппа В – 0,4% пришлось на линию В/Ямагата-подобных и 76,0% - линию В/Виктория-подобных. Прослежены, как и в предыдущие сезоны, различия по долевому участию вирусов гриппа в странах и регионах ВОЗ.
В странах Европейского региона ВОЗ вирусы гриппа детектировали крайне редко, число которых в период одной недели не превышало 60 на (49 неделе 2020г.), с последующим снижением частоты выявления положительных проб; с 21 недели 2021г. детектировали единичные случаи. В целом, к 24 недели 2021г. в Европейском регионе было протестировано более 900 000 образцов, 887 (0,1%) из которых были положительными на грипп: грипп типа А – 448 (50,1%) и грипп типа В – 439 (49,9%); среди субтипированных вирусов гриппа А – 6,0% пришлось на A(H1N1)pdm09 и 12,0% - A(H3N2); среди субтипированных вирусов гриппа В – 0,7% пришлось на линию В/Ямагата-подобных и 2,5% - линию В/Виктория-подобных.
В странах Американского региона ВОЗ вирусы гриппа детектировали также крайне редко, число которых в период одной недели не превышало 140 (на 1 неделе 2021г.), с последующим снижением показателя; с 12 недели 2021г. детектировали не более 40 случаев в неделю. В США, в целом, к 25 неделе 2021г. было протестировано более 520 000 образцов, из которых 0,05% были положительными на грипп: грипп типа А – 160 (61,0%) и грипп типа В – 102 (39,0%); среди субтипированных вирусов гриппа А – 8,0% пришлось на A(H1N1)pdm09 и 10,0% - A(H3N2); среди субтипированных вирусов гриппа В – 3,0% пришлось на линию В/Ямагата-подобных и 7,0% - линию В/Виктория-подобных. В Канаде с августа 2020г. по июнь 2021г. было протестировано более 600 000 образцов, 77 (0,01%) из которых были положительными на грипп: грипп А (71,0%), в том числе A(H1N1)pdm09 – 17%, A(H3N2) – 12,0%; грипп В – 29,0%.
В странах Юго-Восточного региона ВОЗ (11 членов, включая Бангладеш, Бутан, КНДР, Индию, Индонезию, Мальдивы, Мианмар, Непал, Шри-Ланку, Таиланд, Тимор-Лести) была отмечена низкая активность вирусов грипп на протяжении всего анализируемого периода, однако без периодов подъемов и спада: в период одной недели регистрировали от 20 до 40 положительных на грипп образцов, причем, в период с 40 недели 2020г. доминировал вирус гриппа A(H3N2), на смену которому в период с 20 по 24 недели пришел вирус гриппа В линии В/Виктория-подобных; в последующие 2 недели регистрировали большую активность вируса гриппа A(H3N2).
В странах Западного Тихоокеанского региона ВОЗ рост числа положительных на грипп проб был отмечен с 1 недели 2021г., с достижением максимальных показателей в период 21 недели (более 400 проб) и последующим снижением. В целом было протестировано более 390 000 проб. Частота положительных проб на грипп составила 5453 (1,4%). Подавляющее большинство было типировано как грипп В линии В/Виктория-подобных. При этом в некоторых странах активность вирусов гриппа было более высокой, среди которых Вьетнам (9,0%), Лаос (8,4%) и Китай (1,5%).
В странах Африканского региона ВОЗ выявляли активность трех вирусов гриппа – A(H1N1)pdm09, A(H3N2) и гриппа В линии В/Виктория-подобных, однако их активность была неравнозначной: в период с 40 по 43 недели 2020г. доминировал вирус гриппа A(H3N2); с 1-ой недели 2021г. – большую активность проявил вирус гриппа A(H1N1)pdm09. Число положительных проб, выявляемых в течении недели, не превышало 80, с пиковыми значениями в периоды 43 недели 2020г. и 7 недели 2021г.
В странах Восточного Средиземноморского региона ВОЗ в период с 33 недели 2020г. по 22 неделю 2021г. протестировано около 18 000 образцов, 465 (2,6%) из которых оказались положительными на вирусы гриппа: А - 187 (40,0%), в том числе, A(H1N1)pdm09 – 1, A(H3N2) - 157 (34,0%), A/H5 – 8 (1,7%) и В – 278 (60,0%). В период одной недели выявляли не более 30 положительных на грипп образцов.
Характеристика вирусов гриппа (к марту 2021г.). Изучение генетических свойств популяции циркулировавших штаммов выявило их гетерогенность, а также в ряде стран -неполное соответствие штаммов вирусов гриппа A(H3N2) и В свойствам вакцинных вирусов.
Результаты секвенирования штаммов вируса гриппа A(H1N1)pdm09, выделенных в странах Западной Африки, определили их принадлежность к генетической подгруппе 6В.1А5А+187V/A, представленной вакцинным вирусом А/Guangdong-Maonan/SWL1536/2019 в сезоне 2020-2021гг. для стран Северного полушария; при этом часть штаммов содержала дополнительные мутации I166T и A186T. Вакцинный штамм A/Victoria/2570/2019, рекомендованный для стран Южного и Северного полушария в сезоне 2021-2022гг. антигенно отличается от А/Guangdong-Maonan/SWL1536/2019 и представляет генетическую подгруппу 6В.1А5А+156К.
Штаммы вируса гриппа A(H3N2), выделенные в основном в странах Западной Африки, были отнесены к генетической подгруппе 3C.2а1b+T135K-A, представленной референс-вирусом A/Denmark/3264/2019. В тоже время, штаммы, выделенные в Камбоджи (G186S, F193S, Y195F, S198P и K171N) и Бангладеш (Y159N, T160I, L164Q, G186D, D190N, F193S, Y195F), имели дополнительные замены и отличались по антигенным свойствам, определив два новых кластера с характерными аминокислотными заменами. Вирус гриппа А/Hong Kong/2671/2019 (подгруппа 3С.2а1+Т135К-В) был рекомендован в состав гриппозных вакцин для стран Северного и Южного полушария в сезоне 2020-2021г. и вирус А/Cambodia/e0826360/2020 (подгруппа 3C.2а1b+T135K-A) – для стран Северного полушария в сезоне 2021-2022гг.
К марту 2021г. секвенировано 19 штаммов (образцов вируса гриппа линии В/Виктория-подобных, семь из которых были отнесены к генетической подгруппе 1А(∆3). Из семи других штаммов – один, выделенный в США, имел замену в HA1 G133R, шесть, выделенные в Нигерии, Сенегале и Испании, имели замены N150K, G184E, N197D и R279 и сформировали генетическую подгруппу с дополнительными заменами в HA1 (A127T, P144L, T182A, D197E, K203R и T221A). Штаммы отличались по антигенным свойствам от эталона А/Washington/02/2019, который рекомендован в составе гриппозных вакцин в сезонах 2020-2021гг. и 2021-2022гг. для стран Северного и Южного полушарий.
Учитывая низкую активность вируса гриппа В линии В/Ямагата-подобных, популяция изученных штаммов сезона 2020-2021гг. отличалась от эталона В/Phuket/3073/2013 (в составе четырёхвалентных вакцин в сезонах 2020-2021 и 2021-2022гг.) тремя аминокислотными заменами (L172Q, D229N, и M251V), которые не повлияли на изменение антигенных свойств.
Чувствительность эпидемических штаммов вирусов гриппа к противовирусным препаратам.
В исследованиях на чувствительность штаммов вируса гриппа к ингибиторам нейраминидазы (в том числе, секвенированием) было протестировано весьма ограниченное число штаммов, все из них проявили нормальное ингибирование к препаратам с антинейраминидазной активностью (осельтамивиру и к занамивиру).
Рекомендации ВОЗ по составу гриппозных вакцин для стран Северного полушария на сезон 2021-2022 гг.
26 февраля 2021 г. ВОЗ опубликовала рекомендации по составу гриппозных вакцин в 2021-2022гг. в странах Северного полушария.
Четырех-валентные препараты должны содержать компоненты: A/Victoria/2570/2019 (H1N1)pdm09, A/Cambodia/e0826360/2020 (H3N2), B/Washington/02/2019 (линия B/Виктория-подобных) и B/Phuket/3073/2013 (линия B/Ямагата-подобных).
В состав трёхвалентных вакцин в качестве В-вирусного компонента рекомендуют В/Вашингтон/02/2019 (линия В/Виктория/2/87).
3. Инфицирование людей вирусами гриппа других хозяев (сайт ВОЗ на 1 июля 2021г.)
Вирус гриппа птиц A/H5. Ситуация с инфицированием людей вирусами гриппа птиц была относительно благоприятной, последний случай инфицирования вирусом гриппа A(H5N1) был зарегистрирован в Лаосской Народной Демократической Республике 21 октября 2020г. С 2003г. зарегистрировано 862 случая из 17 стран мира, 455 (53%) из которых – с летальными исходами
С 2014г. по настоящее время зарегистрировано 32 лабораторно подтверждённых случая инфицирования людей вирусом гриппа A(H5N6), включая 19 случаев с летальным исходом (в текущем сезоне – 13, Китай, Лаос). Последний случай диагностирован 13 мая 2021г. в Китае.
В России в декабре 2020г. зарегистрировано 7 случаев инфицирования людей вирусом гриппа птиц A(H5N8). Заразились работники птицефермы в Астраханской области в возрасте от 29 до 60 лет, среди них 5 женщин. Вирусы гриппа A(H5N8) были отнесены к кладу 2.3.4.4. В 2020г. вирусы птичьего гриппа A(H5N8) также были обнаружены у домашних и диких птиц в Болгарии, Чехии, Египте, Германии, Венгрии, Ираке, Японии, Казахстане, Нидерландах, Польше, Румынии, Англии и РФ.
Вирус гриппа птиц A/H7. В период текущего эпидемического сезона новых случаев инфицирования вирусом гриппа птиц A(H7N9) детектировано не было (общее число составило 1568, включая 616 - с летальным исходом). Из пяти «волн», регистрируемых с 2013г., последняя (с 1 октября 2016г.) была наиболее высокой, что указывает на большую активность и распространенность в последнее время. Среди изученных штаммов, 33 проявили себя как высокопатогенные (HPAI), и несли мутации в гемагглютинине, ответственные за патогенность для домашней птицы. Однако более высокой трансмиссии по отношению к человеку отмечено не было.
С 2018г. детектирован один случай инфицирования человека вирусом гриппа птиц A(H7N4).
Вирус гриппа птиц A(H9N2). В текущем сезоне детектировано 12 случаев инфицирования людей вирусом гриппа птиц A(H9N2) – 11 случаев в Китае, один – в Камбоджи. Всего с начала наблюдения (декабря 2015 г.) зарегистрирован 51 случай инфицирования (50 случаев – в Китае).
Вирус гриппа птиц A(H10N3). За весь период наблюдения был детектирован один случай инфицирования людей вирусом гриппа птиц A(H10N3) с благоприятным исходом.
Вирус гриппа свиней A(H1N1)v. В текущем сезоне детектировано 12 случаев инфицирования людей вирусом гриппа свиней A(H1N1)v, в том числе, в Китае – 5, США – 4, Канаде – 1, Дании – 1 и Нидерландах – 1.
Вирус гриппа свиней A(H1N2)v. В текущем сезоне детектировано 2 случая инфицирования людей вирусом гриппа свиней A(H1N2)v, в том числе, в Канаде – 1 и Бразилии – 1.
Вирус гриппа свиней A(H3N2)v. В текущем сезоне детектировано 3 случая инфицирования людей вирусом гриппа свиней A(H3N2)v, в том числе, в США – 2 и Австралии – 1.
Случаи инфицирования людей вирусами гриппа птиц и свиней регистрировали в разных возрастных группах, разной степени тяжести, без летальных исходов. Чаще всего они были связаны с тесными контактами с птицей и свиньями. В тоже время, согласно ВОЗ, различные подтипы вируса гриппа А продолжают детектировать среди птиц в странах Европы, Азии и Африки.
4. Инфицирование людей коронавирусами MERS-CoV и SARS-CoV-2. (сайт ВОЗ на 29 июня 2021г.)
Новый коронавирус MERS-CoV (Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus). К настоящему времени с зарегистрировано 2566 лабораторно подтверждённых случаев заражения MERS-CoV в 26 странах, из них 882 - с летальным исходом
Новый коронавирус SARS-CoV-2 (Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus-2). По данным ВОЗ, к 4 июля 2021г. в мире число заболевших новым типом коронавируса SARS-CoV-2 составило 183 198 019 человек, летальный исход зафиксирован в 3 971 687 случаях. Наибольшее число случаев зарегистрировано в таких регионах ВОЗ, как Америки (72 804 991 инфицированных / летальных – 1 914 478), странах Европы 956 235 850 инфицированных/ 1 189 019 летальных) и юго-восточной Азии (35 2019 144 инфицированных / 495 939 летальных). В России диагностировано 5 635 294 случаев инфицирования и 138 579 из них – с летальными исходами.
Особую обеспокоенность вызывают новые варианты SARS-CoV-2, связанные с приобретением вирусом мутаций, ответственных за более высокую вирулентность и способность преодолеть ранее приобретенный иммунитет после перенесенного заболевания или вакцинации. К концу июня 2021г. эпидемическую значимость приобрели 4 варианта вируса: Alpha (клада GR, D.1.1.7, британский, с сентября 2020г.), Beta (клада GH, B.1.351, южноафриканский, с мая 2020г.), Gamma (клада GR, B.1.1.28.1, бразильский, с ноября 2020г.) и Delta (клада G, B.617.2, индийский, с октября 2020г.). Причем отмечены различия по их активности в странах мира и долевому участию. Наибольшее распространение получил вариант Delta: частота его выявления составила 70,8% (Африка), 79,0% (Азия), 83,8 (Европа), 82,1 (Океания), 49,4% (С.Америка) и 1,2% (Ю. Америка). В тоже время, в странах Ю.Америки доминировал вариант Gamma (78,9%); несколько большую активность в странах С. Америки имел вариант Alpha (29,6%).
В связи с вышесказанным, остаются актуальными проблемы диагностики (увеличение числа проб, изученных с применение секвенирования), а также вакцинопрофилактики (создание коллективного иммунитета с охватом прививками не менее 60%, расширение возрастных рекомендаций).
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
Отличительной особенностью эпидемического сезона 2020-2021гг. стала крайне низкая активность вирусов гриппа как в России, так и других странах мира на фоне доминирования нового коронавируса SARS-CoV-2: частота положительных на грипп проб составила 0,2%. Долевое участие распределилось следующим образом: грипп типа А – 2539 (25,0%) и грипп типа В – 7608 (75,0%); среди субтипированных вирусов гриппа А – 14,0% пришлось на A(H1N1)pdm09 и 34,0% - A(H3N2); среди субтипированных вирусов гриппа В – 0,4% пришлось на линию В/Ямагата-подобных и 76,0% - линию В/Виктория-подобных. Прослежены, как и в предыдущие сезоны, различия по долевому участию вирусов гриппа в странах и регионах ВОЗ, в том числе и по городам РФ, сотрудничающим с ЦЭЭГ, Москва.
В ЦЭЭГ поступила информация о 4 образцах, положительных на вирусы гриппа (1 – грипп А, тип не установлен; 3 – вирус гриппа В, тип не установлен).
Все из числа изученных в странах мира (ограниченное число) образцов, положительных на грипп, проявили нормальное ингибирование к препаратам с антинейраминидазной активностью (осельтамивиру и к занамивиру).
Даны рекомендации по составу гриппозных вакцин для стран Северного полушария с заменой двух компонентов вируса гриппа А (A/Victoria/2570/2019 (H1N1)pdm09 и A/Cambodia/e0826360/2020 (H3N2)); компоненты вируса гриппа В не изменились.
Структура и долевое участие некоторых возбудителей ОРВИ (за исключением SARS-CoV-2) также изменились: вирусы парагриппа, аденовирусы, риновирусы и РС-вирус снизили свою активность, в тоже время, прослеживается рост активности бокавируса, альфа-коронавирусов и метапневмовируса в периоды их «сезонной» активности. Все вышесказанное повлияло на вовлеченность разных возрастных групп в эпидпроцесс. В частности, показатели заболеваемости ОРВИ у детей были ниже по сравнению с предыдущими сезонами, в тоже время, у взрослых – повысились. Среди госпитализированных пациентов преобладали лица старше 50 лет – 83,5%. В отделении ОРИТ частота летальных исходов от общего числа наблюдаемых пациентов по причине COVID-19 составила 4,8%, что выше при сравнении со средними показателями по стране (2,5%).
В отчетный период выявлено доминирование нового коронавируса SARS-CoV-2 в структуре ОРВИ, причем отмечена тенденция к снижению частоты выявления положительных проб, на фоне которого выявлен рост числа положительных проб на другие респираторные вирусы негриппозной этиологии. Как и в других странах, популяция SARS-CoV-2 (на примере московских образцов) была гетерогенной; выявлены варианты Alpha и Delta, а также эндемичные только для РФ (B.1.1.317, B.1.1.397 и B.1.1.523.
Прогноз на эпидемический сезон 2021-2022гг. Прогноз на предстоящий эпидемический сезон 2021-2022гг. во многом зависит от распространения нового коронавируса SARS-CoV-2, а также его изменчивости, появлении новых вариантов. На сегодняшний день четко выявлена «биологическая конкуренция» SARS-CoV-2 и вирусов гриппа и, в тоже время, в определенной степени отсутствие таковой в отношении других респираторных вирусов, несмотря на введение карантинно-ограничительных мер. Тем не менее, возможен существенный подъем заболеваемости, вызванный вирусом гриппа.
Для своевременной выработки ответных мер и
предупреждения ущерба необходима максимальная активность вакцинальной кампании по
гриппу и SARS-CoV-2,
непрерывный мониторинг циркуляции возбудителей ОРВИ с привлечением спектра
лабораторных методов, изучение их биологических и молекулярно-генетических свойств.
Важен и своевременный обмен между Национальными центрами по гриппу и
Сотрудничающими центрами по гриппу ВОЗ информацией с предоставлением образцов
эпидемических штаммов и референс-вирусов.