На заседании Ученого совета института заслушан научный доклад старшего научного сотрудника лаборатории биологически активных наноструктур кандидата биологических наук О.Л.Ворониной "Возможности секвенирования геномов в решении задач микробиологии и эпидемиологии".
Секвенирование геномов микроорганизмов предполагает частичный или полный анализ последовательностей ДНК хромосом и плазмид. В докладе отмечено, что целью такого исследования является установление филогенетической связи изучаемых объектов, обнаружение генов, отвечающих за вирулентность, взаимодействие с организмом хозяина и резистентность к антибиотикам, исследование путей метаболизма, регуляции экспрессии белков, поиск вариабельных участков генома, которые могут служить основой дифференциации близкородственных микроорганизмов.
В настоящее время существует несколько баз данных, предлагающих протоколы амплификации и секвенирования фрагментов генома, анализ последовательностей в сравнении с референтными для установления аллельного профиля организма, программы для филогенетического и кластерного анализа штаммов на основе аллельных профилей. Это базы данных Оксфордского университета, Имперского колледжа в Лондоне, института Макса Планка, института Пастера, Мичиганского университета. Сравнение результатов анализа с референтными данными позволяет оценивать распространение в мире выявляемых штаммов, определять их клинические аналоги.
Первым полностью секвенированным и проанализированным геномом стал геном Haemophilus influenzae Rd KW20, представленный в 1995 г. В первое время ежегодно секвенировали 3, затем 6 геномов. В 2007-2008 гг. это количество приблизилось к 200.
На основе данных полного сиквенса геномов возможно исследование биологических функций генов с применением, в том числе, методологии выключения тех или иных генов изучаемого кластера или метаболического пути.