Один из старейших отделов института. Организован академиком Евгением Никаноровичем Павловским в 1933 г.
В разные годы отдел последовательно возглавляли академик Е.Н.Павловский, член-корреспондент АМН СССР Полина Андреевна Петрищева, профессор Валент Викторинович Кучерук, профессор Юрий Григорьевич Чернуха, профессор Юрий Анатольевич Дубровский; с 2000 г. по 2020 г. отделом руководил Заслуженный деятель науки РФ, академик РАЕН, профессор Эдуард Исаевич Коренберг; с апреля 2020 г. по февраль 2023 г. отдел возглавлял кандидат биологических наук Артем Петрович Ткачук.
Основная задача отдела - развитие общебиологических и эпидемиологических основ учения академика Е.Н.Павловского о природной очаговости болезней; изучение эпидемиологии и эпизоотологии наиболее распространенных в России природноочаговых инфекций и их этиологии, а также таксономии и экологии возбудителей этих инфекций, закономерностей структуры и функционирования образуемых ими паразитарных систем; разработка методов, стратегии и тактики профилактики природноочаговых инфекций.
Председатель проблемной комиссии - профессор Э.И.Коренберг.
Руководитель лаборатории - доктор биологических наук С.А.Ермолаева.
Лаборатория создана членом-корреспондентом РАМН, профессором В.Ю.Литвиным, который руководил ею на протяжении многих лет. Основным направлением исследований являлось изучение экологии патогенных бактерий в почвах и водоемах как фундаментальной основы эпидемиологических исследований природноочаговых сапронозных инфекций.
В течение этого времени осуществлен экспериментальный анализ популяционной динамики возбудителей сапронозов как сочленов почвенных и водных экосистем, изучено взаимодействие бактериальных популяций с компонентами почвенных и водных биоценозов с учетом воздействия абиотических факторов среды. На основе экспериментальных данных построены математические модели межпопуляционных связей в процессе циркуляции возбудителей в биоценозах и их передачи по трофическим цепям. Изучены механизмы длительной резервации патогенных бактерий в природных очагах и роль этого явления в развитии эпидемий и эпизоотий.
В настоящее время в лаборатории проводится изучение молекулярно-биологических и генетических механизмов, обеспечивающих экологическую пластичность возбудителей природноочаговых инфекций. Исследуются механизмы внутриклеточного паразитизма в рамках сформулированной профессором В.Ю.Литвиным концепции случайного паразитизма возбудителей сапронозов человека и животных. Оценивается роль факторов патогенности, необходимых в процессе паразитирования в теплокровных хозяевах, для выживания микроорганизмов в естественных биоценозах.
Другое направление современных разработок связано с изучением механизмов регуляции экспрессии факторов патогенности факультативного внутриклеточного паразита Listeria monocytogenes - возбудителя листериоза человека и животных, в зависимости от внешних условий.
Сайт лаборатории http://www.vblgene.org
Старейшая лаборатория отдела. Основана в 1933 году. Лабораторией последовательно руководили: академик Е.Н.Павловский; член-корреспондент АМН СССР П.А.Петрищева; доктор биологических наук И.М.Гроховская; с 1979 г. по декабрь 2022 г. - Заслуженный деятель науки РФ, академик РАЕН, доктор биологических наук, профессор Э.И.Коренберг. В декабре 2022 г. лабораторию возглавила кандидат биологических наук Н.А.Кузнецова.
Итоги научной деятельности лаборатории на разных ее этапах обобщены в 14 монографиях.
Цель деятельности лаборатории - изучение функционального значения членистоногих в поддержании паразитарных систем и воспроизводстве популяции возбудителей облигатно-трансмиссивных инфекций, экологически связанных с клещами, а также закономерностей эпидемического проявления природных очагов этих инфекций.
На базе лаборатории функционирует Центр Минздрава России по боррелиозам, при котором существует постоянно пополняющийся музей боррелий, содержащий в настоящее время около 600 первичных изолятов.
Руководитель лаборатории – кандидат биологических наук А.В.Костарной.
Лаборатория создана в 1972 г. академиком РАН, профессором И.В.Тарасевич, которая руководила ею до начала 2014 г. С 2014 г. по 2018 г. лабораторию возглавлял доктор медицинских наук С.Н.Шпынов.
Основное направление исследований – анализ закономерностей циркуляции и географического распространения патогенных для человека риккетсий, коксиелл и бартонелл с целью обоснования прогноза и разработки мер профилактики и диагностики инфекций, вызываемых этими возбудителями.
Исследования включают: изучение этиологической и пространственной структуры популяций риккетсий и коксиелл; природных и антропургических очагов риккетсиозов, коксиеллеза и бартонеллезов; определение территорий, потенциально опасных в отношении этих инфекций; оценку влияния природных и социальных факторов на популяции риккетсий и коксиелл и их очаги.
В разные годы сотрудники лаборатории изучали риккетсиозы и коксиеллез на территориях Армении, Молдавии, Узбекской республики, Таджикской ССР, г.Москвы. Расшифрованы крупнейшие вспышки лихорадки Ку в Крыму, Воронежской области и Алтайском крае.
Описаны новые для науки риккетсиозы – астраханская пятнистая лихорадка и дальневосточный риккетсиоз, выделены их возбудители от больных, переносчиков и их прокормителей.
Выделено более 100 штаммов риккетсий и коксиелл, депонированных в музей риккетсиальных культур.
Совершенствуются серологические методы исследования. Разработана методика получения антигенов риккетсий, меченных наночастицами, для реакции наноагглютинации.
Разработана инактивированная комбинированная корпускулярная вакцина из коксиелл Бернета против лихорадки Ку. Разработка защищена патентом РФ.
Лаборатория является Центром Минздрава России по риккетсиозам; в 1972-2008 гг. функционировала в качестве Сотрудничающего центра ВОЗ по риккетсиям и риккетсиозам; в полевых и лабораторных исследованиях осуществляла активное международное научное сотрудничество со специалистами США, Франции, Японии, Монголии, Словакии.
Результаты исследований обобщены в более чем 20 монографиях, учебниках и руководствах.Руководитель лаборатории – кандидат биологических наук Н.Е.Шарапова.
Лаборатория лептоспирозов организована в 1936 г. Лабораторией последовательно руководили: профессор С.И.Тарасов, профессор В.И.Терских, профессор В.В.Ананьин, профессор Ю.Г.Чернуха. С 1990 г. по 2018 г. лабораторию возглавляла член-корреспондент РАН, профессор Ю.В.Ананьина.
Лаборатория выполняет функции Центра Минздрава России по лептоспирозам. Является держателем Национальной и Международной коллекции лептоспир, насчитывающей более 700 референтных штаммов и полевых изолятов.
С 1964 г. на базе лаборатории функционировал Сотрудничающий центр ВОЗ по эпидемиологии лептоспирозов. В качестве директора центр возглавляла член-корреспондент РАН Ю.В.Ананьина, член Международного подкомитета по таксономии лептоспир.
Руководитель лаборатории – кандидат биологических наук А.С.Семихин.
Первая туляремийная лаборатория в России создана в 1929 году при Микробиологическом институте Наркомздрава РСФСР, в 1931 г. была переведена в НИИ им.Л.А.Тарасевича, в 1937 г. - во Всесоюзный институт экспериментальной медицины, а с 1945 г. по настоящее время функционирует в составе НИИЭМ им.Н.Ф.Гамалеи. С 1929 по 1948 год лабораторию возглавлял видный ученый Л.М.Хатеневер. В этот период интенсивно изучались практически все научные и прикладные аспекты проблемы: эпидемиология, микробиология, иммунодиагностика, терапия, профилактика; разработаны первые диагностические и лечебные препараты. Наиболее важным и приоритетным открытием стало создание Н.А.Гайским и Б.Я.Эльбертом живой туляремийной вакцины, до настоящего времени являющейся главным средством профилактики туляремии.
С 1949 по 1988 год руководителем лаборатории был член-корреспондент АМН СССР, профессор Н.Г.Олсуфьев. Этот этап был ознаменован крупными фундаментальными и прикладными разработками, многие из которых являлись приоритетными и не утратили актуальности до настоящего времени. Так, впервые была научно обоснована и получила практическое применение теория типизации природных очагов туляремии, осуществлено моделирование инфекции на разных видах диких животных, разработана оригинальная концепция внутривидовой таксономии возбудителя туляремии, которая в последующем нашла подтверждение с помощью современных молекулярно-генетических методов исследования. Создана система методов иммунологической диагностики туляремии, обеспеченная эффективными тест-системами и широко применяемая на практике. Итогом фундаментальных и научно-практических разработок лаборатории явилось создание научно обоснованных стратегии и тактики борьбы с туляремией в последние десятилетия XX века.
С 1988 года по 2016 год лабораторией руководила доктор биологических наук И.С.Мещерякова.С 2000 года лаборатория обеспечивает функционирование Центра Минздрава России по туляремии и осуществляет организационную, методическую, консультативную помощь практическому здравоохранению по совершенствованию эпидемиологического надзора и профилактики туляремии в России.
Руководитель лаборатории - кандидат биологических наук Д.Б.Гончаров.
Лаборатория организована в 1957 г. для всестороннего изучения токсоплазмоза, в 1979 г. она перепрофилирована на изучение лейшманиозов. До 1989 г. лабораторию возглавляла профессор В.М.Сафьянова. В то время лаборатория являлась региональным центром ВОЗ по лейшманиозам и выполняла ряд проектов в рамках Международного банка ВОЗ. Приоритетными направлениями исследований были таксономия лейшманий и видоспецифическая серодиагностика и сероэпидемиология лейшманиозов. С 1989 г. по 2005 г. лабораторией руководил профессор Ю.А.Дубровский. В эти годы лаборатория изучала эпидемиологию и эпизоотологию токсоплазмоза и криптоспоридиоза, разрабатывала новые средства лабораторной диагностики этих заболеваний.
Сотрудниками лаборатории установлено, что природные очаги криптоспоридиоза распространены во всех зонах Евразии. Выявлен широкий диапазон внутривидовой изменчивости криптоспоридий по вирулентности. Выявлены основные закономерности инфицированности токсоплазмами населения различных регионов РФ и возможные группы риска. Разработаны тест-системы для серологической диагностики токсоплазмоза, нашедшие применение в системе практического здравоохранения РФ и ряда стран СНГ. Для повышения специфичности диагностики острого токсоплазмоза разработан "ловушечный" метод с использованием мембранного антигена Р-30; создана и апробирована тест-система на основе ПЦР для идентификации токсоплазм в тканях человеческого организма.
В настоящее время изучается состояние клеточного и гуморального иммунитета при токсоплазмозе; оцениваются особенности функционирования цитокиновой регуляторной сети и возможности применения в терапии заболевания индукторов интерферона; идут разработки по созданию вакцины. На лабораторных моделях ведутся исследования по взаимосвязи токсоплазменной инфекции и факторов старения организма.
В целях разработки комплекса мероприятий по профилактике протозойных инфекций планируются исследования по оценке роли токсоплазмоза в инфекционной патологии человека, изучению таксономии криптоспоридий и изменчивости возбудителей.
Сотрудниками лаборатории подготовлены методические рекомендации по проблеме токсоплазмоза. Коллектив принимал участие в проведении Парламентских слушаний о профилактике паразитарных заболеваний в РФ.